Friday, April 15, 2016

Ecotoxicology

Ecotoxicology is intimately related to ecology, which was defined by Ernst Haeckel (1969). This term highlights everything that has to do with the relationships established between the environment and the organisms that live in it, grouped by populations, communities and ecosystems.

The organisms present different trophic relationships between the base of the trophic chain (primary producers), the secondary ones and the tertiary ones.

In ecotoxicology it is important to know the effects on organisms of several links in this chain, because they are related to each other.

Importance of ecotoxicology:

-Investigate the ecological effects of pollutants on organisms, species, populations, communities and aquatic / terrestrial ecosystems.

-Persistence of pollutants in the environment

-Sensitivity of the species
Abstract: INECC

Bases de datos SIG México

Quisiera compartirte algunos links para descargar datos SIG en México:
CONABIO - plataforma de fácil acceso
INEGI - plataforma básica

En caso que necesites software para desarrollar tus mapas y no dispongas de ninguno que te permita hacer funciones básicas, te recomiendo estos gratuitos:
Mapa digital de escritorio INEGI
QGIS

El programa por excelencia para hacer funciones más aplicadas es ARCGIS / ARCVIEW.

Y si quieres hacer todavía funciones más sencillas, como visualizar mapas o calcular distancias, te recomiendo GOOGLE EARTH PRO

Scientific Writing Course

I would like to recommend a course for scientific writing that I have done, from the page of free courses COURSERA.ORG.

The course is called Writing in the sciences, and is sponsored by Stanford University. It lasts from 4 to 8 weeks, it is in English and you learn how to write a scientific article.

If you finish it in good terms you get a signed certificate.

It is highly recommended because you learn to improve scientific writing techniques and you even learn new tips.

Link del curso en coursera

Estancias

En el doctorado, realizar una estancia en un centro de investigación es muy recomendable, ya que adquieres nuevas experiencias, otros modelos de estudio y nuevos contactos.

Link: Web centros de investigación CONACYT

Fotos de mi mini-estancia, realizada en CIBNOR, La Paz (Baja California Sur):






Links ECOTOXICOLOGY

LINKS

https://studentsofsetacoutreach.wordpress.com/

SETAC,
IUTOX,
BUSCATOX,
AETOX,
TOXIPEDIA,
EPA ECOTOX,
ECOTOXICOLOGÍA Y ECOLOGÍA ACUÁTICA -



Thesis presentations


Through the thesis I made the following presentations of my thesis advances:
  • 1 presentación en International Congress of Toxicology. (Octubre 2016). Publication: Toxicology Letters
  • 2 presentaciones en Congreso Internacional de Ciencias Ambientales (Acapulco junio 2014 y Puebla junio 2015)
  • 2 ponencias en el Foro de Jóvenes Investigadores de Tamaulipas, Poliforum Cd Victoria (Nov 2013 y Octubre 2015)
  • 3 presentaciones en seminarios de investigación, IEA (Mayo 2014, Mayo 2015 y Junio 2016)
  • 7 presentaciones en tutorales de investigación, IEA (Dic 2013, Julio 2014, Dic 2014, Julio 2015, Dic 2015, Julio 2016, Nov 2016)
  • 1 presentación en Expociencia, Cd Victoria Abril 2014

Inglés

Para estudiar el doctorado vas a necesitar un nivel de inglés mínimo, para poder leer la mayor cantidad de artículos posibles, puesto que la mayoría están en este idioma.

Actualmente ya están pidiendo nivel mínimo de TOEFL (500) para acceso y 550 para titulación.

Para ello, te recomiendo ajustar tus horarios para hacer un espacio mínimo para mejorar tu nivel. La opción más económica si haces el doctorado en la UAT es el CELLAP.

Incluso se ofrecen cursos los sábados, veranos y distintos horarios en mañana o tarde.

Materias de doctorado recomendables

Algunas de las materias que he llevado en el Doctorado en Ecología y Manejo de Recursos Naturales del IEA UAT y que más me han gustado:

- Comunicación científica - Dr. J. A. Torres (te enseñará a escribir un artículo de tesis, en distintas fases, con compromiso de terminarlo al final de la materia listo para publicar)

- Análisis multivariados - Dr. C. Venegas (software utilizado: STATISTICA)

- Fisiología de organismos acuáticos: Dra. L. Vázquez Sauceda (prácticas: bioensayo con peces)

- Ecosistemas acuáticos: Dra. R. Aguilar Medrano (prácticas: muestreo básico de agua y muestreo biológico de peces y de hábitat físico en río)

- Acuacultura: Dr. J. Rábago (teoría sobre la acuacultura en México y peces más utilizados, prácticas: muestreo básico de agua)

- Sistemas de información geográfica: Dra. G. Requena (software utilizado: ARCVIEW 3.2)

- Bioestadística: Dr. R. Pérez Castañeda (software utilizado: STATISTICA)

Aquatic Organisms of my thesis

During my thesis I made some shots, for the observation of these organisms.

Here I leave a link so you can observe them:

CLICA AQUÍ


Sampling

There are some protocols for water sampling in aquatic bodies.

Some necessary elements are:

- Clean bottles for the sample

- Electronic equipment for reading basic physicochemical parameters

- Proper clothing

If you are going to perform microbiological sampling, you will need sterile bottles or prefabricated sterile bags.

Sampling example with waterproof half-length feet:

Microalgae culture

Microalgae cultures for bioassays should remain under controlled conditions, such as:

- Sterile conditions

- Controlled air inlet

- Light darkness

- Temperature

- Nutrient medium

- Oxygen

For maintenance you will need some elements, such as:

- Sturdy glass bottles to sterilize them, cotton and aluminum stoppers, sterilizer or autoclave, lamps, isolated place, pipettes and sterile tips, flame lighter, etc.

Photograph of microalgae kept in my laboratory:


Organisms


Test organisms are used to evaluate their responses to contaminants. These can be native species or model species from other laboratories. Most used examples: - Pseudokirchneriella subcapitata: freshwater microalgae - Zebrafish - Daphnia magna: freshwater cladocean crustacean


I am currently working with these agencies. If you want information from any of them, I can help you in what you need to know.

Toxic Assays

Toxicity tests is a methodology to evaluate toxic responses on aquatic organisms, which have been exposed to pollutants.

Some examples of tests:

- Acute toxicity tests:
They are usually used for substances in high concentrations and the observation of the effects in 24-96 hours. Example: Average lethal concentration (LC50)

- Chronic toxicity tests:
For substances at lower concentrations, in a longer observation time, which may be up to 3 months. Example: inhibition of growth after a period of time.

Water Quality Methods

Currently there are several methods to measure the quality of water in aquatic bodies.

The traditional method is through physicochemical indicators. With this method it is evaluated that the parameters do not exceed the limits established in the regulations, for the protection of aquatic life. However, it is not possible to evaluate the biological effect on aquatic organisms.

Biological methods allow to evaluate responses on aquatic organisms, through different evaluations, such as:

- Indicator species: tolerant or sensitive to pollutants, based on observations in the field.

- Structure of the community of organisms in a determined place, with respect to reference conditions

- Physiological changes

- Acute toxicity

- Chronic toxicity

- Other effects

Normas mexicanas agua

Estas son las principales normas mexicanas que establecen límites de control en cuerpos cuerpos acuáticos y alcantarillado.

- NORMA Oficial Mexicana NOM-001-ECOL-1996, Que establece los lí­mites máximos permisibles de contaminantes en las descargas de aguas residuales en aguas y bienes nacionales.



Resumen: Límites descarga en cuerpos acuáticos  LINK: DOF NOM 001

- NOM 002 Establece los límites máximos permisibles de contaminantes en las descargas de aguas residuales a los sistemas de alcantarillado urbano o municipal. (03 Jun 1998)


Resumen: Límites descarga en alcantarillado LINK: DOF NOM 002


- ACUERDO por el que se establecen los Criterios Ecológicos de Calidad del Aguas CE-CCA-001/89



Resumen: Niveles guía de referencia para protección de la vida acuática LINK: CE89

Este acuerdo, aunque no es Norma Oficial Mexicana, es importante por ser la única en establecer unos criterios de referencia para los cuerpos acuáticos y la protección de la vida acuática, en México.

Nota: Posteriormente publicaré otras normas de importancia